Le parti comprend des sections communales dans de nombreuses communes genevoises. Les grandes sections sont organisées de manière similaire au PVL Genève. Toutefois, elles disposent une organisation relativement libre et d'une certaine marge de manœuvre dans les prises de positions sur des sujets communaux. Les sections communales ou intercommunales représentent le Parti vert'libéral genevois au niveau communal.