Le Comité directeur, composé de 16 membres, est l'organe de pilotage du parti. Il met en œuvre la politique du parti dans le respect des lignes directrices.
Il délègue au Bureau (photo ci-contre) le traitement des affaires courantes, telles que la préparation des séances du comité, l'exécution des décisions qui y sont prises, la communication du parti, ou encore le suivi quasi-quotidien des dossiers et de l'actualité. Le Bureau est composé de la présidence cantonale, des présidents des sections Ville de Genève et Jeunes vert'libéraux Genève, ainsi que du secrétaire général.